中科院直屬機關黨委（部門）由中編辦批準成立，為院機關內設機構（正局級）。直屬機關黨委的主要職責為：

　　負責院機關、京區單位黨的工作；負責全院黨風廉政建設和反腐敗工作；負責全院黨的宣傳、意識形態和思想政治工作；與院黨的建設工作領導小組辦公室合署辦公，指導推進全院黨建工作；與院直屬機關紀律檢查委員會合署辦公，履行監督執紀責任，受理對所屬黨組織、黨員違紀行為的檢舉、控告和申訴，查處院機關、京區單位黨組織、處級及以下黨員違紀案件；負責院統一戰線工作；領導和支持院工會、共青團、婦工委等群團組織開展工作，承擔院體協工作等。

　　中共中國科學院直屬機關委員會于2017年7月3日成立，在中央和國家機關工委的領導和中國科學院黨組的指導下開展工作，全面負責院部機關、京區科研院所和京區企業等單位黨的工作。中共中國科學院直屬機關委員會的現任領導成員為：

　　書記：陰和?。妫?；

　　常務副書記：李和風（兼）；

　　副書記：孫曉明（兼）、王維佐、劉京紅、楊旭；

　　副書記、紀委書記：劉紅輝。